Anja Bråthen Kristoffersen
|
|
![[*]](pictures/anja.gif)
Stilling: Førsteamanuensis II (20% stilling, jobber
hver onsdag)
Gruppe: Biomedical Research Group
Institusjon: Institutt for Informatikk
Kontor: rom 416, Gaustadalleen
25
Telefon: 22 84 47 85
Email: anjab@ifi.uio.no
Adresse: Institutt for informatikk, Pb 1080, 0316 Oslo
Faglig profil:
Jeg jobber på Blindern kun en dag i uken, de fire andre dagene i uken jobber jeg på Veterinærinstituttet som forsker. Mine prosjekter har et vidt spenn, men med statistikk/bioinformatikk som fellesnevner.
Fortiden jobber jeg mest med:
- Analyse av data fra fiskeoppdrettsnæringen for å identifisere årsaken til store sykdomsutbrudd og utbredelse av lakselus.
- Klustering av gener og individer fra mikroarray forsøk.
- Analyse av sekvenseringsdata for å finne ukjente virussekvenser som forårsaker kjente sykdommer hos fisk og dyr.
- Utbredelse av flått i Norge
Emner jeg har
undervist i:
- INF3350/INF4350
- Grunnkurs i bioinformatikk
- INF 3340 Statistiske metoder i bioinformatikk
- INF 1000 Grunnkurs i objektorientert programmering
- INF5330/INF 325
Bioinformatikk
- IN
370 Estimering i Praksis
- IN 396 Ulineære systemers dynamikk
Masterstudenter
Stian Engebretsen
Eirik Mistereggen
Ferdige masterstudenter
Torunn Dønvik, Sammenligning av sekvens entropi hos mobile genetiske elementer og kromosomalt DNA (ferdig april 10)
Arne Olaf
Godtland, Aligning of short sequences to
whole genomes and a program to verify PCR primers (ferdig mai 07)
Irja Wold
Sætre, Detection of horizontal transfer
events in eukaryotes using bioinformatics methods, with a focus on incorporated
dietary DNA
(ferdig mai 07)
Merete
Worren, Estimation of missing values
in microsatellite data with a K-Nearest Neighbours method (ferdig desember 06)
Harald Børresen Visual comparer og VC-combiner: et verktøy som sammenligner genmodeller
og presenterer resultatet både grafisk og statistisk, og en
kombineringsalgoritme som kombinerer genmodeller (ferdig desember 05)
Daniel Løkken Rustad, Developing an interactive web-based learning environment for
bioinformatics (ferdig september 05)
Thao Huong Le, Optimal probeutvelgelse for DNA chip designet for å detektere
genmodifikasjon (ferding mai 05)
Inger Solberg, Ittero : multippelt sammenstillingsprogram for kodende
nukleinsyresekvenser basert på evolusjonære modeller (ferdig
august 04)
Håvard Nesvold, Design of a DNA chip for detection of unknown geneticallymodified
organisms (GMOs) (ferdig august 03)