Java Runtime Environment må være installert på maskinen for å kunne vise appleten.
Den kan lastes ned direkte fra Java.com: JRE
Input til Visual Comparer:
Sequence fasta file (Skal brukes i vinduet øverst til venstre): Sequence
Solution output (Skal brukes i vinduet øverst til høyre): Solution
FGenesH output (Skal brukes i vinduet nederst): FGenesH
Genscan output (Skal brukes i vinduet nederst): Genscan
HMMgene output (Skal brukes i vinduet nederst): HMMgene
Bruksanvisning:
1. Åpne opp filen Sequence.txt i en texteditor.
2. Marker all teksten med ctrl+A og kopierer den med ctrl+C.
3. Gå til tekstområdet i Sequence-boksen i innlesningsbildet til Visual Comparer.
4. Få fokus i tekstområdet og trykk ctrl+V for å lime inn tekst.
Gjenta disse trinnene for innlesning av Solution.txt, men bruk tekstområdet øverst til høyre isteden.
For innlesning av spådommene til gensøkingsprogrammene må det i tillegg
velges riktig gensøkingsprogram fra listen over tekstområdet.
Trykk på knappen NEXT mellom hver innlesningen av spådommene, og etter
innlesning av den siste spådommen
brukes FINISHED-knappen istedet.
I alignmentskjermbildet kan VC-Combiner kjøres ved å trykke Combiner-knappen øverst i menyen av vinduet.